آنالیز فیلوژنتیک توالی ژن pol (سکانس RT ) ویروس HIV-1 در بین بیماران مبتلا به ایدز در ایران

  چکید ه   سابقه و هدف   ویروس نقص ایمنی اکتسابی، یکی از اعضای خانواده رتروویریده می‌باشد که به عنوان عامل سندرم نقص ایمنی اکتسابی شناخته شده است. توالی‌یابی و آنالیز فیلوژنتیک ژن pol ویروس نقص ایمنی اکتسابی، یک روش مفیـد برای تعیین تحت گونه­ای سویه­ها می‌باشد. در این پژوهش، هدف بررسی سویه‌های ویروس HIV-1 موجود در ایران بود.   مواد و روش‌ها   مطالعه انجام شده از نوع تجربی بود. ژنوم RNA ، از پلاسمای 24 بیمار مبتلا به ایدز از مرکز تحقیقات ایدز بیمارستان امام خمینی استخراج گردید و با استفاده از روش RT Nested – PCR و استخراج از ژل محصولات PCR ، سکانس‌یابی و آنالیز فیلوژنتیک با نرم افزار مگا4 انجام و تفاوت­های سکانس­های RT بین سویه­های ویروس HIV-1 به دست آمده از بیماران بررسی شد.   یافته‌ها   پس از انجام توافق ترادفی توالی‌ها با توالی‌های رفرانس، آنالیز سکانس­ها و فیلوژنتیک نشان داد که 14 نمونه تحت گونه A1 و 10 نمونه تحت گونه B از گروه M ویروس HIV-1 می‌باشند.   نتیجه گیری   سویه A1 بیشتر در افراد معتاد به مواد مخدر تزریقی و سویه B در افراد هموفیلی مشاهده شد. نتایج نشان داد که احتمالاً تحت گونه A1 شایع‌ترین تحت گونه در بین بیماران است. مانند سایر تحقیقات انجام شده در کشورهای دیگر، آنالیز فیلوژنتیک می‌تواند در استراتژی پیشگیری، درمان، کنترل و برنامه‌ریزی‌ها مفید باشد.   کلمات کلیدی : ویروس نقص ایمنی اکتسابی تیپ 1، ایران، تنوع ژنتیکی